Los objetivos del Hatha Yoga en varias tradiciones indias han sido los mismos que los de otras variedades de Yoga. Estos incluyen Siddhis físicos (poderes especiales, beneficios corporales como la ralentización de los efectos de la edad, poderes mentales) y la liberación espiritual (moksha, mukti). Algunos de los Siddhis son referencias simbólicas a los preciados objetivos soteriológicos de las religiones indias.
Sin embargo, la mayoría de los textos históricos de Hatha Yoga no dan ninguna importancia a los Siddhis. La práctica principal consideró la búsqueda de poderes mentales como una distracción o un obstáculo al objetivo final del Hatha Yoga: la liberación espiritual, el autoconocimiento o liberación del renacimiento, que las tradiciones indias llaman mukti o moksha.